染色体结构的变异主要包括以下4种类型缺失，染色体某一片段的缺失2、增添、染色体增加了某一片段3、倒位、染色体的某一片段颠倒180°4、易位、染色体某一片段移接到另一条非同源染色体上原因;在某些自然或人为因素的作用下，染色体可能发生断裂，断裂端具有愈合和重结的能力。

当染色体在不同区段发生断裂后，在同一条或不同条染色体之间以不同方式重接时会导致结构变异的出现。